MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 2945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010474	A	7	7	4	10	100 %	0 %	0 %	0 %	170076471
2	NC_010474	TGG	2	6	71	76	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076471
3	NC_010474	CGC	2	6	136	141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076471
4	NC_010474	GAT	2	6	145	150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076471
5	NC_010474	CCG	2	6	151	156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076471
6	NC_010474	ACCCA	2	10	232	241	40 %	0 %	0 %	60 %	170076471
7	NC_010474	TG	3	6	286	291	0 %	50 %	50 %	0 %	170076471
8	NC_010474	GTG	3	9	289	297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076471
9	NC_010474	AACTCG	2	12	311	322	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170076471
10	NC_010474	GCCCAA	2	12	358	369	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	170076471
11	NC_010474	T	6	6	374	379	0 %	100 %	0 %	0 %	170076471
12	NC_010474	CTA	2	6	438	443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076471
13	NC_010474	AGC	2	6	534	539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076471
14	NC_010474	ATT	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076471
15	NC_010474	A	6	6	597	602	100 %	0 %	0 %	0 %	170076472
16	NC_010474	CAAC	2	8	626	633	50 %	0 %	0 %	50 %	170076472
17	NC_010474	CCG	2	6	652	657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076472
18	NC_010474	TGT	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076472
19	NC_010474	G	6	6	728	733	0 %	0 %	100 %	0 %	170076472
20	NC_010474	TCGAT	2	10	775	784	20 %	40 %	20 %	20 %	170076472
21	NC_010474	GTG	2	6	933	938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076472
22	NC_010474	CGG	3	9	949	957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076472
23	NC_010474	GAA	2	6	987	992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076472
24	NC_010474	GCG	2	6	1032	1037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076472
25	NC_010474	A	6	6	1040	1045	100 %	0 %	0 %	0 %	170076472
26	NC_010474	CTG	2	6	1054	1059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076472
27	NC_010474	ACCT	2	8	1193	1200	25 %	25 %	0 %	50 %	170076472
28	NC_010474	AAC	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076472
29	NC_010474	CTC	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076472
30	NC_010474	ACC	2	6	1325	1330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076472
31	NC_010474	A	6	6	1342	1347	100 %	0 %	0 %	0 %	170076472
32	NC_010474	TAT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076474
33	NC_010474	A	6	6	1532	1537	100 %	0 %	0 %	0 %	170076474
34	NC_010474	TGG	2	6	1547	1552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076474
35	NC_010474	ATT	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076474
36	NC_010474	A	6	6	1577	1582	100 %	0 %	0 %	0 %	170076474
37	NC_010474	TTCT	2	8	1672	1679	0 %	75 %	0 %	25 %	170076474
38	NC_010474	TGG	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076474
39	NC_010474	CGATCG	2	12	1697	1708	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170076474
40	NC_010474	TGCC	2	8	1751	1758	0 %	25 %	25 %	50 %	170076474
41	NC_010474	G	6	6	1800	1805	0 %	0 %	100 %	0 %	170076474
42	NC_010474	GGT	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076474
43	NC_010474	CGA	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076474
44	NC_010474	CAT	2	6	1926	1931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076474
45	NC_010474	GGC	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076473
46	NC_010474	GCA	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076473
47	NC_010474	A	6	6	2124	2129	100 %	0 %	0 %	0 %	170076473
48	NC_010474	GTT	2	6	2248	2253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076473
49	NC_010474	CG	3	6	2309	2314	0 %	0 %	50 %	50 %	170076473
50	NC_010474	GCG	2	6	2447	2452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076473
51	NC_010474	GCCA	2	8	2498	2505	25 %	0 %	25 %	50 %	170076473
52	NC_010474	CGG	2	6	2526	2531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076473
53	NC_010474	ACT	2	6	2710	2715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076475
54	NC_010474	ATA	2	6	2729	2734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076475
55	NC_010474	ATC	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076475
56	NC_010474	CAC	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076475
57	NC_010474	CAAA	2	8	2913	2920	75 %	0 %	0 %	25 %	170076475
58	NC_010474	CTT	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076475
59	NC_010474	AG	3	6	3175	3180	50 %	0 %	50 %	0 %	170076475
60	NC_010474	CTCC	2	8	3256	3263	0 %	25 %	0 %	75 %	170076475
61	NC_010474	T	6	6	3355	3360	0 %	100 %	0 %	0 %	170076475
62	NC_010474	TAA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076475
63	NC_010474	GAC	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076475
64	NC_010474	TC	3	6	3571	3576	0 %	50 %	0 %	50 %	170076475
65	NC_010474	ACT	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
66	NC_010474	CCA	2	6	3879	3884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076476
67	NC_010474	TC	3	6	3900	3905	0 %	50 %	0 %	50 %	170076476
68	NC_010474	TCT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076476
69	NC_010474	TGAGC	2	10	4122	4131	20 %	20 %	40 %	20 %	170076476
70	NC_010474	A	6	6	4183	4188	100 %	0 %	0 %	0 %	170076476
71	NC_010474	TGAT	2	8	4228	4235	25 %	50 %	25 %	0 %	170076476
72	NC_010474	GGTT	2	8	4313	4320	0 %	50 %	50 %	0 %	170076476
73	NC_010474	CAAA	2	8	4413	4420	75 %	0 %	0 %	25 %	170076476
74	NC_010474	CAT	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
75	NC_010474	CCT	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076476
76	NC_010474	GAA	2	6	4507	4512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076476
77	NC_010474	GATC	2	8	4536	4543	25 %	25 %	25 %	25 %	170076476
78	NC_010474	CCA	2	6	4563	4568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076476
79	NC_010474	GTT	2	6	4650	4655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
80	NC_010474	GGT	2	6	4726	4731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076476
81	NC_010474	C	6	6	4749	4754	0 %	0 %	0 %	100 %	170076476
82	NC_010474	ATA	2	6	4894	4899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
83	NC_010474	CCT	3	9	4982	4990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076476
84	NC_010474	GGGCTT	2	12	5019	5030	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	170076476
85	NC_010474	TGT	2	6	5091	5096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
86	NC_010474	GTT	3	9	5121	5129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
87	NC_010474	ACT	2	6	5233	5238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
88	NC_010474	AAT	2	6	5259	5264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
89	NC_010474	GAA	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076476
90	NC_010474	AGC	2	6	5338	5343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076476
91	NC_010474	TC	3	6	5374	5379	0 %	50 %	0 %	50 %	170076476
92	NC_010474	TAA	2	6	5397	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
93	NC_010474	AG	3	6	5436	5441	50 %	0 %	50 %	0 %	170076476
94	NC_010474	TTGA	2	8	5650	5657	25 %	50 %	25 %	0 %	170076476
95	NC_010474	TAA	2	6	5688	5693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
96	NC_010474	TCT	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076476
97	NC_010474	ACC	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076476
98	NC_010474	AAAC	2	8	5815	5822	75 %	0 %	0 %	25 %	170076476
99	NC_010474	AAT	2	6	6035	6040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
100	NC_010474	CGT	3	9	6046	6054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076476
101	NC_010474	AAT	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
102	NC_010474	GGGC	2	8	6126	6133	0 %	0 %	75 %	25 %	170076476
103	NC_010474	CAT	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
104	NC_010474	TTG	2	6	6193	6198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
105	NC_010474	GTT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076477
106	NC_010474	TGT	2	6	6413	6418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076477
107	NC_010474	AATT	2	8	6465	6472	50 %	50 %	0 %	0 %	170076477
108	NC_010474	TAG	2	6	6588	6593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076477
109	NC_010474	ATT	2	6	6612	6617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076477
110	NC_010474	G	6	6	6670	6675	0 %	0 %	100 %	0 %	170076477
111	NC_010474	AAT	2	6	6721	6726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076477
112	NC_010474	CT	3	6	6739	6744	0 %	50 %	0 %	50 %	170076477
113	NC_010474	T	6	6	6851	6856	0 %	100 %	0 %	0 %	170076477
114	NC_010474	GATC	2	8	6857	6864	25 %	25 %	25 %	25 %	170076477
115	NC_010474	GCG	2	6	6875	6880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076477
116	NC_010474	GAAG	2	8	6917	6924	50 %	0 %	50 %	0 %	170076477
117	NC_010474	AAT	2	6	6951	6956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076477
118	NC_010474	CCTGG	2	10	6962	6971	0 %	20 %	40 %	40 %	170076477
119	NC_010474	TCA	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076477
120	NC_010474	ATTTG	2	10	7009	7018	20 %	60 %	20 %	0 %	170076477
121	NC_010474	GAT	2	6	7037	7042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076477
122	NC_010474	ATTG	2	8	7060	7067	25 %	50 %	25 %	0 %	170076477
123	NC_010474	TCG	2	6	7334	7339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076477
124	NC_010474	GAC	2	6	7707	7712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076478
125	NC_010474	G	6	6	7795	7800	0 %	0 %	100 %	0 %	170076478
126	NC_010474	AATT	2	8	7859	7866	50 %	50 %	0 %	0 %	170076478
127	NC_010474	AAT	2	6	7940	7945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076478
128	NC_010474	ACT	2	6	7967	7972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076478
129	NC_010474	T	7	7	8024	8030	0 %	100 %	0 %	0 %	170076478
130	NC_010474	GCTA	2	8	8042	8049	25 %	25 %	25 %	25 %	170076478
131	NC_010474	TC	3	6	8069	8074	0 %	50 %	0 %	50 %	170076478
132	NC_010474	GAT	2	6	8143	8148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076478
133	NC_010474	GAT	2	6	8227	8232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076478
134	NC_010474	GGC	2	6	8258	8263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076478
135	NC_010474	ACG	2	6	8267	8272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076478
136	NC_010474	CAG	2	6	8399	8404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076478
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150	NC_010474	TTGGGT	2	12	9125	9136	0 %	50 %	50 %	0 %	170076478
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265	NC_010474	CGA	2	6	17028	17033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076482
266	NC_010474	GC	3	6	17056	17061	0 %	0 %	50 %	50 %	170076482
267	NC_010474	GGT	2	6	17119	17124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076482
268	NC_010474	AGC	2	6	17236	17241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076482
269	NC_010474	C	7	7	17264	17270	0 %	0 %	0 %	100 %	170076482
270	NC_010474	T	6	6	17306	17311	0 %	100 %	0 %	0 %	170076482
271	NC_010474	T	6	6	17323	17328	0 %	100 %	0 %	0 %	170076482
272	NC_010474	GCT	2	6	17342	17347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076482
273	NC_010474	TGG	2	6	17375	17380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076482
274	NC_010474	GCA	2	6	17431	17436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076482
275	NC_010474	CCA	2	6	17475	17480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076482
276	NC_010474	T	7	7	17567	17573	0 %	100 %	0 %	0 %	170076482
277	NC_010474	GGTA	2	8	17590	17597	25 %	25 %	50 %	0 %	170076482
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279	NC_010474	T	6	6	17642	17647	0 %	100 %	0 %	0 %	170076482
280	NC_010474	ATT	2	6	17699	17704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076482
281	NC_010474	CGC	2	6	17709	17714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076482
282	NC_010474	T	6	6	17747	17752	0 %	100 %	0 %	0 %	170076482
283	NC_010474	TGATGC	2	12	17762	17773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170076482
284	NC_010474	CAG	2	6	17824	17829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076483
285	NC_010474	CAT	2	6	17889	17894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076483
286	NC_010474	A	8	8	17917	17924	100 %	0 %	0 %	0 %	170076483
287	NC_010474	ACC	2	6	17966	17971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076483
288	NC_010474	AAT	2	6	17992	17997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076483
289	NC_010474	AAT	2	6	18004	18009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076483
290	NC_010474	A	6	6	18245	18250	100 %	0 %	0 %	0 %	170076483
291	NC_010474	AAT	2	6	18275	18280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076483
292	NC_010474	TCC	2	6	18332	18337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076483
293	NC_010474	A	7	7	18340	18346	100 %	0 %	0 %	0 %	170076483
294	NC_010474	GTG	2	6	18349	18354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076483
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298	NC_010474	TCGG	2	8	18660	18667	0 %	25 %	50 %	25 %	170076484
299	NC_010474	GAG	3	9	18700	18708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076484
300	NC_010474	CGG	4	12	18789	18800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076484
301	NC_010474	GGC	2	6	18837	18842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076484
302	NC_010474	CAT	2	6	18940	18945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076484
303	NC_010474	GCG	2	6	18961	18966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076484
304	NC_010474	GCA	2	6	19029	19034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076484
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307	NC_010474	A	6	6	19172	19177	100 %	0 %	0 %	0 %	170076484
308	NC_010474	GGC	2	6	19198	19203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076484
309	NC_010474	AGGGG	2	10	19204	19213	20 %	0 %	80 %	0 %	170076484
310	NC_010474	CGG	2	6	19408	19413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076485
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314	NC_010474	CT	3	6	19614	19619	0 %	50 %	0 %	50 %	170076485
315	NC_010474	ACC	2	6	19640	19645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076485
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326	NC_010474	ACC	2	6	20319	20324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076485
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330	NC_010474	CCAATG	2	12	20812	20823	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170076486
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334	NC_010474	AAT	2	6	21225	21230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076486
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343	NC_010474	ATTA	2	8	22321	22328	50 %	50 %	0 %	0 %	170076488
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362	NC_010474	TAAT	2	8	23107	23114	50 %	50 %	0 %	0 %	170076488
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380	NC_010474	GCA	2	6	24089	24094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076489
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395	NC_010474	TTC	2	6	24841	24846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076489
396	NC_010474	A	6	6	24851	24856	100 %	0 %	0 %	0 %	170076489
397	NC_010474	TGGCTG	2	12	24983	24994	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	170076489
398	NC_010474	GGAT	2	8	25011	25018	25 %	25 %	50 %	0 %	170076489
399	NC_010474	TGC	2	6	25019	25024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076489
400	NC_010474	TAGA	2	8	25027	25034	50 %	25 %	25 %	0 %	170076489
401	NC_010474	TTC	3	9	25210	25218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076489
402	NC_010474	CCAA	2	8	25281	25288	50 %	0 %	0 %	50 %	170076489
403	NC_010474	TTGC	2	8	25303	25310	0 %	50 %	25 %	25 %	170076489
404	NC_010474	AAT	2	6	25329	25334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076489
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409	NC_010474	CAA	2	6	25498	25503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076489
410	NC_010474	GTT	2	6	25511	25516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076489
411	NC_010474	TCA	2	6	25586	25591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076489
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417	NC_010474	ATT	2	6	25837	25842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076489
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421	NC_010474	TAT	2	6	26120	26125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076490
422	NC_010474	TAAA	2	8	26126	26133	75 %	25 %	0 %	0 %	170076490
423	NC_010474	AAGA	2	8	26163	26170	75 %	0 %	25 %	0 %	170076490
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430	NC_010474	AT	3	6	26591	26596	50 %	50 %	0 %	0 %	170076490
431	NC_010474	TAA	2	6	26598	26603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076490
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465	NC_010474	CT	4	8	28716	28723	0 %	50 %	0 %	50 %	170076492
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471	NC_010474	AGGCC	2	10	28867	28876	20 %	0 %	40 %	40 %	170076492
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492	NC_010474	TCG	3	9	30156	30164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076493
493	NC_010474	TCA	2	6	30201	30206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076493
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497	NC_010474	TGT	2	6	30484	30489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076493
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500	NC_010474	AAT	2	6	30586	30591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076493

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